百度开源肿瘤识别AI算法 准确率超专业病理医生
笔墨哥 发布于2018-06 浏览:35249 回复:311
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近日,百度研究院发表论文提出一种名为“神经条件随机场”的全新病理切片分析算法,将肿瘤识别定位准确率大幅提高。在公开数据集 Camelyon 16大赛测试集上,该算法的肿瘤定位 FROC 分数达到0.8096,超过专业病理医生水平以及由哈佛和麻省理工学院联合团队所保持的最好成绩。

除了病理学切片分析方面的研究,百度还在积极探索 AI 在眼底影像、放射影像、以及智能问诊等其他一些医疗领域的应用。

一直以来,病理切片分析都是癌症诊断中的黄金标准。但是即便对于经验丰富的病理医生来说,病理切片的阅片流程也十分困难复杂。一张40倍放大的电子化病理切片通常由超过十亿个像素点组成,磁盘空间大小超过1GB。

然而淋巴结附近微转移肿瘤细胞群可能最小只有不到1000像素的直径。而一旦发现微转移肿瘤细胞群,病人的治疗方案和预后可能就会有极大差别。因此,详尽的阅读病理切片,且不漏掉任何一处具有临床价值的病灶,如同大海捞针,是一项十分复杂和耗时的任务(如图一所示)。

为了帮助病理医生更有效地阅读病理切片,研究人员提出了许多深度学习算法,来预测病理切片中的肿瘤细胞区域。由于原始病理切片的图片尺寸十分庞大,绝大部分深度学习算法只能将每张病理切片剪切成大量尺寸小些的图块,比如256x256像素。这样经典的深度卷积网络就可以被用来训练及预测每张图块是否是肿瘤区域。

然而在不知道图块周边区域的情况下,仅凭单张图块,有时候很难预测其是否为肿瘤区域,尤其是在肿瘤与正常组织交界部位。由此产生的假阳性也十分显著。


当病理医生碰到这种困难的情况时,通常会缩小当前感兴趣的图块,以观测周边区域,作出更准确的判断。类似的,百度研究院提出一种全新的深度学习算法,一次性输入一组3x3的图块,并联合预测每一张图块是否有肿瘤区域。图块之间的空间关系可以通过一种名为“条件随机场”的概率图模型来模拟。整套算法框架可以在 GPU 上进行端到端的训练,而不需任何后处理的步骤(如图所示)。


由于考虑到了相邻图块之间的空间关系,该算法让假阳性得以大大降低,算法预测的肿瘤区域也更加平滑(如图四所示)。对比之前的算法,这种算法除了真实肿瘤区域外,几乎没有引入任何其他假阳性区域。


图四. (a) 原始病理切片; (b) 病理医生标注,其中白色部分为肿瘤区域; (c) 以前算法预测的肿瘤区域; (d) 百度研究院“神经条件随机场”算法预测的肿瘤区域。

在 Camelyon 16大赛的测试集上,“神经条件随机场”算法获得了高达0.8096的肿瘤定位 FROC 分数,不仅显著超越了专业的病理医生水平(0.7240),也超过了之前大赛的最好成绩(0.8074)。同时,百度研究院也在 Github 上开源了整套算法代码,以便其他研究人员在此基础上进行更深入的研究,促进人工智能在医学图像分析领域取得更加长足的发展。

在提高病理切片检测的效率、准确性上,这种新的肿瘤检测算法拥有很大潜力。它让病理学家能更聚焦由算法突出的肿瘤区域,而不必搜索整个切片。当然,对算法的全面评估,也需要更大的数据集来做进一步临床研究。

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共311条回复 最后由用户已被禁言回复于2022-04
#113我就是九候回复于2018-11

病理切片的知识很高端

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#112蓝色的风339回复于2018-11
#111 秘密花园jay回复
这真不是一个人能完成的 不但要懂技术相关行业也要了解

真肯定需要一个跨学科的专家团队

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#111秘密花园jay回复于2018-11
该评论已删除

这真不是一个人能完成的 不但要懂技术相关行业也要了解

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#110天空之城23568回复于2018-11

病理切片看起来生动

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#109蓝色的风339回复于2018-11
#106 Bzjgis回复
而且关键是识别的准,还操作简单,对于基层医疗比较薄弱的地区是个很好的福利
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是啊,对基层人员是一个很好的帮助

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#107秘密花园jay回复于2018-11
#105 笔墨哥回复
没技术,想到也仅仅是个创意~

恩 所以百度的程序员们太辛苦了 为他们加油

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#106Bzjgis回复于2018-11
#102 笔墨哥回复
嗯,百度的医疗确实让人有点震撼....能帮助很多人。尤其是心灵的窗口——眼睛
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而且关键是识别的准,还操作简单,对于基层医疗比较薄弱的地区是个很好的福利

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#105笔墨哥回复于2018-11
#104 秘密花园jay回复
真的是只有想不到 没有做不到的

没技术,想到也仅仅是个创意~

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#104秘密花园jay回复于2018-11
#102 笔墨哥回复
嗯,百度的医疗确实让人有点震撼....能帮助很多人。尤其是心灵的窗口——眼睛
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真的是只有想不到 没有做不到的

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#103笔墨哥回复于2018-11
#99 worddict回复
是啊,可以建立人体的实时监控体系

便携式的医疗硬件么

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#102笔墨哥回复于2018-11
#100 Bzjgis回复
看百度世界大会,AI在医疗中又有新的落地了

嗯,百度的医疗确实让人有点震撼....能帮助很多人。尤其是心灵的窗口——眼睛

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#101笔墨哥回复于2018-11
#96 蓝色的风339回复
那是肯定的,不过这也节省很多了

嗯,而且打印的时间还可以先做点其他的事情~

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#100Bzjgis回复于2018-11
#98 worddict回复
未来会不会变成人类住手帮助AI大夫

看百度世界大会,AI在医疗中又有新的落地了

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#99worddict回复于2018-11
#91 秘密花园jay回复
以后让ai分析细胞或者病毒的发展情况,给病人更及时准确的提醒

是啊,可以建立人体的实时监控体系

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#98worddict回复于2018-11

未来会不会变成人类住手帮助AI大夫

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#97worddict回复于2018-11
#94 笔墨哥回复
嗯,可以看看我昨天转的那篇【度传记】的帖子,就有 ai帮助大夫 的故事~
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未来很可能AI大夫是主流了

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#96蓝色的风339回复于2018-11
#95 笔墨哥回复
不过打印报告还是需要一点时间的~

那是肯定的,不过这也节省很多了

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#95笔墨哥回复于2018-11
#93 蓝色的风339回复
结果当场出来,比以前不知道快了多少倍

不过打印报告还是需要一点时间的~

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#94笔墨哥回复于2018-11
#91 秘密花园jay回复
以后让ai分析细胞或者病毒的发展情况,给病人更及时准确的提醒

嗯,可以看看我昨天转的那篇【度传记】的帖子,就有 ai帮助大夫 的故事~

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#93蓝色的风339回复于2018-11
#90 笔墨哥回复
很简单,刷脸排号,然后根据工作人员的要求睁眼闭眼,然后刷脸取结果。速度快...片子拍的也蛮清晰的
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结果当场出来,比以前不知道快了多少倍

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